第一，促使動脈硬化。
豆製品含有極為豐富的蛋氨酸，蛋氨酸在酶的作用下可轉化為半胱氨酸。它會損傷動脈管壁內皮細胞，使膽固醇和甘油三酯沉積於動脈壁上，導致動脈硬化形成。
第二，促使痛風發作。
豆腐含嘌呤較多，嘌呤代謝失常的痛風病人和血尿酸濃度增高的患者，多吃豆腐易導致痛風發作。
第三，導致碘缺乏。
製作豆腐的大豆含有的皂角甙，會加速體內碘的排泄。長期過量食用豆腐很容易引起碘缺乏，導致碘缺乏病。
第四，增加腎臟負擔。
在正常情況下，人吃進體內的植物蛋白質經過代謝，最後大部分成為含氮廢物，由腎臟排出體外。人到老年，腎臟排泄廢物的能力下降，此時若不注意飲食，大量食用豆腐，攝入過多的植物性蛋白質勢必會使體內生成的含氮廢物增多，加重腎臟的負擔，不利於身體健康。
第五，對精子有害。
英國科學家實驗室初步研究發現：大豆中一種植物化學物質可能對精子有害。據路透社報道，英國研究人員稱，在大豆中發現的一種植物化學物質可能對精子有害，影響男性的生育能力。